中国国际问题研究院是新中国第一家国际问题研究机构。1956年“中国科学院国际关系研究所”成立,1973年更名为“国际问题研究所”,1986年正式定名为“中国国际问题研究所”。2014年6月,经中央机构编制委员会办公室批准,更名为“中国国际问题研究院”。2019年12月26日,外交部依托中国国际问题研究院成立“习近平外交思想研究中心”。2020年,经中央全面深化改革委员会审议批准,中国国际问题研究院入列国家高端智库建设试点单位。
自建院至今,中国国际问题研究院历经13位院(所)长。现任院长为陈波。